Огляд найбільш поширених обчислювальних методів вивчення зв’язків між структурою молекул та їх біологічною дією

Abstract

Ціль. Систематизувати найбільш поширені методи дослідження зв’язків «молекулярна структура-біологічна активність» (QSAR) та розкрити їх принципи реалізації, сильні та слабкі сторони. Методи. Проводився огляд сучасної наукової літератури, присвяченої QSAR-моделюванню. Найбільш часто використовувані методи розробки моделей «структура-активність» вибирались для подальшого опису. Результати. Визначено місце аналізу зв’язків «молекулярна структура-активність» серед комп’ютерних методів розробки нових лікарських засобів та описано найбільш поширені алгоритми по-будови QSAR моделей із акцентуванням на механізмі їх роботи. У останній час все більшої і більшої по-пулярності набувають підходи, що базуються на використанні ансамблів моделей, прикладом яких є Random Forest. Висновки. Прогрес у розвитку методів машинного навчання для побудови моделей «структура-активність» є запорукою подальшого розвитку напрямку QSAR та знаходження нових біологічно активних речовин із його допомогою