1. Електронний репозитарій ДВНЗ "УжНУ"
2. Факультети
3. Біологічний факультет
4. Кафедра генетики, фізіології рослин та мікробіології
5. Наукові публікації кафедри генетики, фізіології рослин та мікробіології

Назва:	PGP: платформа для комплексного аналізу геномної різноманітності.
Автори:	Волфсбергер, В. Щубелка, Х.М. Олексик, О.Т. Гасинець, Я.С. Пацкун, С. Вакерич, М.М. Кіш, Р.Я. Мірутенко, В.С. Мірутенко, В.В. Которачі, К.А. Поп, К. Неагу, О. Балте, К. Герман, Х. Маре, П. Думітра, С. Папіу, Г. Герменеан, А. Олексик, Т.Х.
Ключові слова:	обчислювальний конвеєр, біоінформатика, геноми.
Дата публікації:	2023
Бібліографічний опис:	Волфсбергер В., Щубелка Х., Олексик О. Т., Гасинець Я., Пацкун С., Вакерич М., Кіш Р., Мірутенко В., Мірутенко В., Которачі К. А., Поп К., Неагу О., Балте К., Герман Х., Маре П., Думітра С., Папіу Г., Герменеан А., Олексик Т. К. PGP: платформа для комплексного аналізу геномної різноманітності. Науковий вiсник Ужгородського унiверситету. Серiя: Бiологiя. 2023. Випуск 55. C. 28-34
Опис:	Популяційні геномні проєкти відіграють ключову роль у глобальних зусиллях з дослідження різноманіття геномів людських популяцій. Різноманітні бар’єри ускладнюють такі ініціативи, серед яких відсутність біоінформатичних знань та відтворюваних стандартизованих методів популяційного аналізу становлять одну з основних перешкод, що обмежують їхній потенціал. Масштабовані, автоматизовані та зручні у використанні обчислювальні конвеєри можуть допомогти дослідникам із мінімальними навичками програмування подолати ці виклики без необхідності глибокого вивчення біоінформатики. PopGenPlayground (PGP) – це оптимізований обчислювальний конвеєр, що працює за допомогою єдиної команди, розроблений для аналізу геноміки людських популяцій з використанням системи управління робочими процесами Snakemake. Створений для автоматизації вторинного аналізу даних національних геномних проєктів, він використовує загальнодоступні геномні бази даних для порівняльного аналізу та анотації варіантів. PGP є мультиплатформенним і надійним обчислювальним конвеєром для популяційного аналізу, який спрощує процес аналізу та знижує вимоги до рівня знань, необхідних для проведення початкового популяційного аналізу в рамках національного геномного проєкту. PGP забезпечує комплексний інструментарій для вторинного аналізу, який можна використовувати як на персональному комп’ютері, так і на віддалених високопродуктивних обчислювальних платформах.
Тип:	Text
Тип публікації:	Стаття
URI (Уніфікований ідентифікатор ресурсу):	https://dspace.uzhnu.edu.ua/jspui/handle/lib/69497
Розташовується у зібраннях:	Наукові публікації кафедри генетики, фізіології рослин та мікробіології

Усі матеріали в архіві електронних ресурсів захищені авторським правом, всі права збережені.