НЕЧІТКА МОДЕЛЬ ВИДАЛЕННЯ НЕІНФОРМАТИВНИХ ПРОФІЛІВ ЕКСПРЕСІЇ ГЕНІВ ЗА СТАТИСТИЧНИМИ ТА ЕНТРОПІЙНИМИ КРИТЕРІЯМИ

Abstract

Подано результати досліджень щодо формування підмножин взаємно-експресованих профілів експресії генів для подальшої реконструкції генних регуляторних мереж. Запропоновано технологію видалення неінформативних генів за статистичними критеріями та ентропією Шеннона з урахуванням ступеня пріоритетності відповідного критерію. Розроблено нечітку модель формування підмножини інформативних профілів експресії генів, валідація якої здійснювалася шляхом застосування класифікатора до об’єктів, що містять значення експресії виділених у підмножини генів як атрибути. Результати класифікації об’єктів, що містять як атрибути дані експресії генів у виділених підмножинах, показали високу ефективність запропонованої моделі, оскільки значення критеріїв класифікації об’єктів відповідали рівню інформативності відповідної групи профілів експресії генів. Ключові слова: експресія генів, статистичні критерії, ентропія Шеннона, нечітка логіка, критерії класифікації, ROC-аналіз