ЗАСТОСУВАННЯ АНАЛІЗУ ГЕННОЇ ОНТОЛОГІЇ ДЛЯ ФОРМУВАННЯ ПІДМНОЖИНИ ЗНАЧУЩИХ ГЕНІВ

Abstract

Охарактеризовано подальший розвиток технології формування підмножин взаємно-експресованих та значущих профілів експресії генів для подальшого їх застосування у системах діагностики на основі даних експресії генів. Запропоновано технологію видалення неінформативних генів за статистичними критеріями із застосуванням аналізу генної онтології, враховуючи кількість генів та характер їх взаємодії. Подано результати практичної реалізації запропонованої технології із застосуванням даних експресії генів пацієнтів, що досліджувалися на різні типи раку. Аналіз отриманих результатів показав високу ефективність запропонованої моделі. Із 19947 профілів експресії генів було виділено 14487 значущих генів, при цьому точність класифікації зразків, що містять як атрибути виділені значущі гени становила 97,6 %. Із 619 зразків, що становили тестову підмножину даних тільки 15 були ідентифіковані некоректно. Представлені дослідження створюють умови для підвищення ефективності гібридної моделі діагностики складних об’єктів на основі даних експресії генів. Ключові слова: аналіз генної онтології, експресія генів, тест Фішера, моделювання, класифікація.